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科普报告:分子标记辅助选择(MAS)育种

分享一则由埃及农业基因工程研究所(AGERI)的Dina El-Khishin教授撰写《Marker Assisted Selection(MAS,标记辅助选择)》的报告,系统介绍了分子标记在植物育种中的应用,特别是如何利用MAS技术应对气候变化背景下的作物改良需求。

MAS的基本概念

  • 定义:MAS是一种利用DNA分子标记而非(或辅助)表型性状进行植物选择的育种方法。
  • 核心目标:提高育种效率,缩短育种周期,尤其在复杂或难以表型筛选的性状上更具优势。

MAS的前提条件

  1. 1. 高效的DNA提取与标记系统(如SSR、SNP、RAPD等)
  2. 2. 高密度遗传图谱(用于定位与性状相关的标记)
  3. 3. 标记与性状之间的明确关联
  4. 4. 强大的数据管理系统(处理大量样本与标记数据)

MAS的优势

  • 可早期选择:在幼苗阶段即可识别基因型,节省时间和资源。
  • 不受环境影响:尤其适用于病虫害、逆境胁迫等表型难以稳定评估的性状。
  • 隐性性状识别:避免传统回交中繁琐的自交或测交步骤。
  • 多基因聚合(Pyramiding):可将多个抗病基因整合到一个品种中,提高抗性持久性。
  • 提高低遗传力性状的选择效率
  • 成本效益:某些性状(如线虫抗性)用标记筛选比田间表型鉴定更经济。

MAS的局限与挑战

  • 初期成本高(设备、技术、人力)
  • 标记与目标基因可能发生重组,导致选择误差(建议标记距离目标基因<5 cM或使用两侧标记)
  • QTL定位不准确(区间大、效应估计偏高)
  • 标记在不同群体中的通用性差
  • 需将研究用标记转化为“育种友好”标记(如将RFLP转化为STS,RAPD转化为SCAR)

MAS的主要育种策略

策略名称

简要说明

Marker-Assisted Backcrossing (MABC)

将目标基因导入优良品种,减少连锁累赘,加快背景恢复。

Gene Pyramiding

将多个抗病/抗逆基因聚合到同一品种中。

Early Generation MAS

在F2/F3阶段淘汰不良基因型,集中资源于少数优良系。

Combined Approaches

标记选择与表型选择结合,提升选择准确性或降低成本。

其他相关技术

  • MARS(标记辅助轮回选择):对多个QTL进行选择,适用于复杂性状。
  • GWS(全基因组选择):基于全基因组标记信息进行预测选择,适用于复杂性状育种。

结论

MAS已被证明是一种有效的育种工具,未来随着基因功能研究的深入和成本降低,其应用将更加广泛。但需优化策略、降低成本,并与传统育种方法有机结合,才能最大化其潜力。

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